Da Vinci's Demons 2 tiếp tục kể về cuộc đời và sự nghiệp của Leonardo da Vinci, về những bất công, khổ cực và cả những niềm vui mà một người thiên tài như ông đã trải qua khi ông là một kẻ dị giáo, người chống lại những sai lầm của tôn giáo. Phần 2 được bắt đầu từ sau âm mưu lật đổ gia đình Medici bởi Pazzi và Vatican. Da vinci đang nỗ lực trốn chạy để cứu mạng sống của Lorenzo, trong khi hắn tìm cách để giết bằng được ông...